Taxonomerは、使いやすいインターフェースで超高速にメタゲノムの配列解析および可視化を行うことができるウェブツールです。このツールを使って、包括的なバクテリアの検出および発見、宿主のmRNA発現プロファイリングなどを簡単に行うことができ、またそれらの結果の可視化を対話的に行うことができます。今回は、サンプルデータを使って基本的な機能を紹介するとともに、ニューヨーク地下鉄のメタゲノムデータ(New York City MTA subway samples Metagenome)を使って、データ解析の方法とその結果の見方について紹介します。