ArrayExpressはEuropean Bioinformatics Institute (EBI)が開発・維持している遺伝子発現情報のデータベースです。ArrayExpressは、NCBI GEOと双璧をなすデータベースで、主にマイクロアレイやNGS実験で得られた72,349実験分、2,388,277アッセイ分(2019年9月時点)のデータが収録されています。それらの中から、自分の興味のある発現データセットや遺伝子プロファイルを検索することができるだけでなく、それらの生データを自由にダウンロードすることが可能です。 今回は、ArrayExpressからNGSやマイクロアレイ実験で得られたデータを検索し、その生データを取得する方法について紹介します。