この動画が再生されない場合は、YouTubeでご覧ください。https://youtu.be/Vlh8ocDOxqI
遺伝子発現データベース／遺伝子発現解析ツール @ AJACS番町3
本日の統合TVは、2019年8月7日に開催された統合データベース講習会:AJACS番町3から、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS)/バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) 坊農 秀雅 による「遺伝子発現データベース／遺伝子発現解析ツール」をお送りします。約1時間18分です。
本講習では、公共の遺伝子発現データベースについて理解を深め、それらから必要なデータを探し出して再利用できるようになることを目標に、主に以下の内容を紹介しています。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、公共の遺伝子発現データベースについて理解を深め、それらから必要なデータを探し出して再利用できるようになることを目標に、主に以下の内容を紹介しています。
- AOE (All Of gene Expression)を使って、興味ある実験データセットを絞り込む
- OmicsDI (Omics Discovery Index)を使って、興味あるオミックスデータセットを検索する
- RefExを使って、組織特異的遺伝子を検索する
- Metascapeを用いて、発現データの結果を生物学的に解釈する
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
Highlights
- 00:04 はじめに
- 05:04 研究現場で頻繁に使われるDBやツールを知る: 統合TV
- 08:28 遺伝子発現DBとは
- 21:56 遺伝子発現DBの使い方
- 42:43 個々の遺伝子の発現プロファイルなどを調べる
- 01:03:29 数十～数千の遺伝子群の生物学的解釈
Download the video file
190922_AJACS77_06_bono.mov