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ChIP-Atlas: 既報のChIP-seqデータをフル活用できる ＠ AJACS町田
本日の統合TVは、2018年12月14日に開催された統合データベース講習会:AJACS町田から、九州大学大学院 医学研究院 沖 真弥 助教 による「ChIP-Atlas: 既報のChIP-seqデータをフル活用できる」をお送りします。約1時間18分です。
本講習では、ChIP-Atlasを使って、論文などで報告されたChIP-seqデータの閲覧や、データマイニングができるようになる方法について実例をもとに紹介しています。
この動画と講習資料が同時に見られる「講習会 実習資料(AJACS)」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、ChIP-Atlasを使って、論文などで報告されたChIP-seqデータの閲覧や、データマイニングができるようになる方法について実例をもとに紹介しています。
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Highlights
- 00:00 1. イントロ
- 18:27 2. IGV のインストール
- 22:53 3. 個別データの閲覧
- 32:00 4. 複数データをまとめて閲覧する
- 44:01 5. 転写因子の標的遺伝子を探す
- 51:44 6. 共局在する転写因子を探す
- 55:41 7. エンリッチメント解析
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190113_AJACS74_04_oki.mov