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ゲノムデータベースとそれを活用した配列解析入門 @ AJACS筑波4
本日の統合TVは、2018年7月10日に開催された統合データベース講習会:AJACS筑波4から、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 坊農 秀雅 による「ゲノムデータベースとそれを活用した配列解析入門」をお送りします。約1時間50分です。
本講習では、主にゲノムデータベースとゲノムブラウザ、塩基配列データベース、大域的アラインメントと局所的アラインメント、多重配列アラインメントと分子系統樹、タンパク質モチーフ・ドメイン検索の使い方や方法について実習形式で紹介しています。
この動画と講習資料が同時に見られる「講習会 実習資料(AJACS)」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、主にゲノムデータベースとゲノムブラウザ、塩基配列データベース、大域的アラインメントと局所的アラインメント、多重配列アラインメントと分子系統樹、タンパク質モチーフ・ドメイン検索の使い方や方法について実習形式で紹介しています。
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Highlights
- 08:27 1. 研究現場で頻繁に使われるDBやツールを知る: 統合TV
- 14:00 2. ゲノムデータベースとゲノムブラウザ
- 15:24 2-1. NCBI
- 19:37 2-2. ゲノムブラウザ
- 39:44 3. 塩基配列データベース
- 49:14 4. 配列解析入門
- 51:29 4-1. 大域的アラインメントと局所的アラインメント
- 55:19 4-2. BLAST
- 01:20:41 4-3. 多重配列アラインメントと分子系統樹
- 01:33:05 4-4. タンパク質モチーフ・ドメイン検索
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180820_AJACS70_02_bono.mov