公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う
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AOEを使って遺伝子発現データベースの統計を見ながら検索する 2018
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AOEを使って遺伝子発現データベースの統計を見ながら検索する 2018
AOE (All Of gene Expression)は、DBCLSが提供する公共遺伝子発現データベースの目次サイトです。マイクロアレイやRNA-Seq等によって得られた遺伝子発現データを生物種や登録年、測定方法などの条件を指定して検索することができます。絞り込み条件に応じて動的に描画されるヒストグラムからデータを選択、項目を選択してリスト表示することによって、直感的に遺伝子発現データベースを検索でき、オリジナルデータに素早くアクセスできるのが特徴です。今回はその基本的な使い方について紹介します。
Highlights
- 00:30 1. 生物種別でリストを検索する
- 01:09 2. データリストの見方
- 01:54 3. データ登録件数のグラフからデータ登録数を絞り込む
- 02:45 4. 研究種別でリストを検索する
- 03:36 5. データリストの条件検索
- 04:00 6. データリストIDのダウンロード
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180731_AOE.mov