公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う
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NCBI GEO の使い方2 〜遺伝子プロファイルの検索・処理済みデータの取得〜 2018
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NCBI GEO の使い方2 〜遺伝子プロファイルの検索・処理済みデータの取得〜 2018
NCBI GEO (Gene Expression Omnibus)はNCBIが提供・維持管理している遺伝子発現情報のデータベースです。今回はGEOの使い方第2弾として、GEOに登録されている多くのマイクロアレイデータのなかから興味のある遺伝子のプロファイルを検索する方法、およびその実験データの正規化されたファイルの取得方法を紹介します。
Highlights
- 00:18 1. NCBI GEO のトップページを検索する
- 00:31 2. 興味のある遺伝子を検索する
- 00:55 3. データセットの説明とグラフの見方
- 01:47 4. 目的遺伝子の発現量の比較する
- 02:25 5. 実験データの信頼度を確認する
- 03:28 5. 前処理済みのデータを取得する
- 03:52 5. ダウンロードしたデータの見方
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180501_GEO_2.mov