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DOGAN - Genome Database of Microorganisms Sequenced at NITE - の使い方
DOGANは、NITE (独立行政法人製品評価技術基盤機構) で全ゲノム配列を解析した微生物のゲノム情報を提供するDBです。産業上有用な微生物や系統的に基準となる微生物を中心に解析が行われています。本動画ではDOGANの特徴とその基本的な使い方を、醤油醸造の乳酸菌として知られる Tetragenococcus halophilus という微生物のゲノムを例にして具体的に紹介します。
Highlights
- 00:51 1. DOGANトップページの紹介
- 02:17 2. <i>Tetragenococcus halophilus</i>のゲノム情報
- 02:40 3. Mapの使い方
- 03:57 4. ORFページの見方
- 05:20 5. Search機能の活用
- 06:32 6. BLAST機能の使い方
- 06:54 7. アミノ酸配列、塩基配列の入手
- 07:27 8. Category Search機能の使い方
- 08:51 9. データの一括ダウンロード
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160418DOGAN.mov