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COILSとPaircoil2を使ってコイルドコイル構造を予測する
COILSと
Paircoil2は、アミノ酸配列からコイルドコイル構造の位置を予測するプログラムです。 コイルドコイル構造とは、二本以上のαヘリックスが組み合わさって形成されたタンパク質構造モチーフの一つで、7残基繰り返しの特徴的な周期配列を持ちます。今回は、酵母の転写活性化因子であるGCN4のアミノ酸配列を例として用い、COILSとPaircoil2を使った予測方法を解説します。