データ解析講習会：AJACS「生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う」
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TogoID による生命科学データベースの横断利用 @ データ解析講習会：AJACS「生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う」
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TogoID による生命科学データベースの横断利用 @ データ解析講習会：AJACS「生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う」
本日の統合TVは、2025年6月26日に開催されたデータ解析講習会：AJACS「生命科学分野におけるナレッジグラフとオントロジーを知って・学んで・使う」から、ライフサイエンス統合データベースセンター 池田 秀也 による「TogoID による生命科学データベースの横断利用」(講習スライド、Q&A)をお送りします。
TogoID は遺伝子、タンパク 質、化合物、文献など異なるデータベースで使われる ID を相互に変換・連携できる公開サービスです。本講義では、ウェブブラウザ上で ID 間の対応関係を取得する基本操作から、遺伝子シンボルなどのラベルを ID に変換する機能、RESTAPI による自動化、オントロジーとの併用で得られる統合解析の例まで、実践的な横断利用の手法を紹介します。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
TogoID は遺伝子、タンパク 質、化合物、文献など異なるデータベースで使われる ID を相互に変換・連携できる公開サービスです。本講義では、ウェブブラウザ上で ID 間の対応関係を取得する基本操作から、遺伝子シンボルなどのラベルを ID に変換する機能、RESTAPI による自動化、オントロジーとの併用で得られる統合解析の例まで、実践的な横断利用の手法を紹介します。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
見どころダイジェスト
- 00:37 1. 概要
- 02:21 2. 生命科学データベース利用におけるID変換の必要性
- 04:43 3. TogoIDについて
- 15:28 4. 対象データベース
- 16:59 5. 様々な利用例
- 23:15 6. REST API
- 24:05 7. TogoID Ontology
- 25:24 8. TogoID RDF版をRDF Portalで提供
- 28:00 9. IDペア取得プログラムの開発と公開
- 29:16 10. ID変換において注意するべき点
- 31:03 11. まとめ
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250801_ikeda.mov