RefSeqとは、NCBI Reference Sequence Database の略で、NCBIが提供・維持管理する配列解析の基準として参照(Reference)するための高品質な遺伝子配列データベースのことです。その配列の多くは核酸配列データベースの
DDBJや
EMBL、
GenBank由来であり、それらの中からもっとも代表的な配列としてふさわしいものを専門家が選び出し整理、注釈付をされています (
About RefSeq)。今回は、このRefSeqデータベースから自分の興味ある遺伝子のRefSeq IDを調べ、そのmRNA配列とアミノ酸配列を取得する方法について説明しています。また、おまけとして
all[filter]と検索することでNCBIデータベースの全エントリ数を調べられる方法も紹介しています。