バイオインフォマティクスツール･パッケージを自作する
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転写制御データ基盤のためのシスエレメント・データベースの開発 @ Bio"Pack"athon2022#9
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転写制御データ基盤のためのシスエレメント・データベースの開発 @ Bio"Pack"athon2022#9
2022年9月2日に開催された、Bio"Pack"athon 2022 #9の粕川 雄也 氏による「転写制御データ基盤のためのシスエレメント・データベースの開発」をお送りします。本講演では、FANTOM5プロジェクトのデータや、各種データベースを統合することで、独自のシスエレメントデータベースの開発計画について紹介します。
この講演動画は、Bio”Pack”athon（バイオパッカソン）からご寄託いただきました。
Bio”Pack”athonでは、以下のような活動をしています。
- ・パッケージ開発に関するミートアップ(月一開催)
- ・日本語によるパッケージング教材の拡充化
- ・Bioconductorへの登録サポート
見どころダイジェスト
- 00:00 1. 転写制御データ基盤のためのシスエレメント・データベースの開発
- 00:23 2. 自己紹介
- 01:14 3. 背景1 (FANTOMプロジェクト)
- 04:55 4. 背景2 (refTSS)
- 07:56 5. 背景3 (SCPortalen)
- 09:32 6. 統合的転写データ基盤
- 11:50 7. シスエレメントデータベース
- 12:16 8. シスエレメントとは
- 19:40 9. ASURAT
- 21:44 10. シスエレメント位置と多型の関連
- 23:40 11. データベースの構築
- 24:26 12. まとめ
- 25:55 13. 質問タイム
動画ファイルのダウンロード
220904_kasukawa.mov