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GlyCosmosを使って糖鎖の情報を検索する
GlyCosmos Portalは、日本糖質学会の公式ポータルとして認定されている、糖鎖科学とライフサイエンスの融合を目指したWebポータルです。JST/NBDCライフサイエンスデータベース統合化推進プログラム「糖鎖科学ポータルの構築」プロジェクト下で開発されており、創価大学糖鎖生命システム融合研究所が運用管理しています。
リポジトリ（Submissions）からは、国際糖鎖構造リポジトリであるGlyTouCanと、グライコミクス・グライコプロテオミクスのための質量分析データリポジトリであるGlycoPOSTにアクセスすることができます。そして2020年8月より、質量分析から同定された糖鎖構造データのリポジトリUniCarb-DRがスウェーデンから移行され新たに追加されました。
データセット（Resources）では、遺伝子、タンパク質、脂質、糖鎖、複合糖質、グライコーム、パスウェイ、疾患についてのデータがまとめられており、網羅的に検索することができます。
トップページのData Resources上のアイコンをクリックすると、GlyCosmos内のデータリストページまたは、参照先のデータベースのページに移動することができます。
Standardsには、GlycoRDFなど糖鎖科学に関連するオントロジーや、GlyCosmosが推奨する糖鎖の各表記法の詳細ページへのリンクがあります。
リポジトリ（Submissions）からは、国際糖鎖構造リポジトリであるGlyTouCanと、グライコミクス・グライコプロテオミクスのための質量分析データリポジトリであるGlycoPOSTにアクセスすることができます。そして2020年8月より、質量分析から同定された糖鎖構造データのリポジトリUniCarb-DRがスウェーデンから移行され新たに追加されました。
データセット（Resources）では、遺伝子、タンパク質、脂質、糖鎖、複合糖質、グライコーム、パスウェイ、疾患についてのデータがまとめられており、網羅的に検索することができます。
トップページのData Resources上のアイコンをクリックすると、GlyCosmos内のデータリストページまたは、参照先のデータベースのページに移動することができます。
Standardsには、GlycoRDFなど糖鎖科学に関連するオントロジーや、GlyCosmosが推奨する糖鎖の各表記法の詳細ページへのリンクがあります。
見どころダイジェスト
- 00:50 1. GlyCosmosトップページ
- 01:36 2.「Submissions(リポジトリ)」
- 02:36 3.「Resources(データセット)」
- 03:00 3-1. GlyCosmos Glycogenes
- 04:49 3-2. GlyCosmos Glycoproteins
- 06:14 3-3. GlyCosmos Lectins
- 06:36 3-4. GlyCosmos Glycolipids
- 07:03 3-5. GlyCosmos Glycans
- 07:21 3-6. GlyCosmos Glycans Search
- 11:24 3-7. Glycome Atras
- 12:02 3-8. GlyCosmos Pathway
- 13:34 3-9. GlycoMaple
- 14:18 3-10. GlyCosmos Organisms
- 14:48 4. 「Standards」
動画ファイルのダウンロード
201124_GlyCosmos.mov