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次世代シークエンサ(NGS)のデータをDDBJ Sequence Read Archive (DRA)に登録する
DDBJ Sequence Read Archive (DRA)は、次世代シーケンサからの出力データのためのデータベースです。DRA は INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration)(日本語による説明(DDBJウェブサイト))のメンバーであり、NCBI Sequence Read Archive (SRA)とEBI Sequence Read Archive (ERA) との国際協力のもと、運営されています。公開された Analysis以外のデータは3極で自動的にミラーリングされます。次世代シーケンサー(NGS)データを学術論文で公表する場合、シーケンサーから出力された配列データを公共データベースに登録することが必要です。特に生データの登録は必須である場合が増えてきています。この生データをDRAに登録することができます。この動画では、DRAにデータ登録する際に必要なプロセスを、トランスクリプトームデータ（NGSの生データ）を例に説明します。
- データ登録に際して、以下の注意点があります。
- 研究責任者 (principal investigator) の許可なくデータを登録しないでください。
- ヒトを対象とした研究データの登録について
- 研究対象者に由来するデータを DDBJ センターが運営するデータベースに登録する場合、研究対象者の尊厳及び人権は、適用されるべき法令、指針、ガイドライン、登録者が所属している機関の方針に従い、登録者の責任において保護されている必要があります。原則として、研究対象者を直接特定し得る情報はメタデータから取り除いてください。ヒトを対象とした研究データを登録する場合は「ヒトを対象とした研究データの登録について」https://www.ddbj.nig.ac.jp/policies.html#human を熟読してください。
- 特許に関連するデータの登録について
- 登録するデータが特許に関連する場合は、「特許出願に関連する塩基配列の登録に関する注意、データの優先権」https://www.ddbj.nig.ac.jp/policies.html#disclaimer の内容を必ずご確認ください。
見どころダイジェスト
- 01:31 1. 登録アカウントの作成
- 03:11 1-a. 公開鍵の作成
- 05:16 2. DRA登録を作成しデータファイルをアップロード
- 05:21 2-a. データの構成
- 08:27 3. プロジェクトとサンプル情報を登録
- 09:07 3-a. Submission
- 09:46 3-b. Bioproject
- 13:18 3-c. Biosample
- 16:30 4. ExperimentとRunを登録
- 16:33 4-a. Experiment
- 18:26 4-b. Run
- 19:16 4-c. MD5チェックサム値
- 20:34 5. シークエンスデータファイルの検証処理
- 21:46 6. 登録の更新
動画ファイルのダウンロード
190523_DRA.mov