Ensembl Genome Browserは、 European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)(欧州バイオインフォマティクス研究所) で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムのことです。 今回は、Ensemblを使って遺伝子の塩基配列を生物種間で比較し、そのアラインメントを作成・閲覧する方法について紹介します。以前の番組で紹介した Clustal Omega を使ってマルチプルアラインメントを行うと内容的に似ていますが、Clustal Omegaを用いる場合は比較する塩基配列を自分で用意する必要があります。Ensemblではその手間が省けるほか、遺伝子のプロモーター配列が存在する上流配列などを付加した上で簡単にアラインメントを作成することができます。また、近縁種や生物種別のセットがすでに用意されているため、生物種間の比較を簡単に実行できることが特徴です。