公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う
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IMOTA を使って、組織別に分類された様々なマルチオミクスデータ(miRNA/mRNA/protein)を調べる
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IMOTA を使って、組織別に分類された様々なマルチオミクスデータ(miRNA/mRNA/protein)を調べる
IMOTA (Interactive Multi-Omics-Tissue Atlas) は各組織や細胞におけるmiRNAやmRNA、タンパク質の相互作用や発現量について調べることができる対話型のマルチオミクスアトラスです(原著論文: IMOTA: an interactive multi-omics tissue atlas for the analysis of human miRNA-target interactions.)。各種オミクスデータ(Sources)を各臓器別に分類した統計情報を示すグラフから、インタラクティブに絞り込みや検索をすることができます。また、IMOTAでは、miRNAの標的や相互作用についての情報がまとめられていることが特長の一つです。
見どころダイジェスト
- 00:18 1. IMOTA を google で検索する
- 00:52 2. IMOTA で整理されているオミクスデータを確認する
- 01:40 3. miRNA との相互作用を調べる
- 03:08 4. 目的の遺伝子をターゲットにする miRNA を検索する
- 03:46 5. miRNA と遺伝子の組み合わせで相互作用している組織を検索する
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190331_IMOTA.mov