TIBCO Spotfireは、Windows環境で利用できるデータ可視化・解析ソフトウェアです。ドラッグアンドドロップなどの簡単な操作で大量のデータから表やグラフを素早く作成し解析できることが特長です。今回は、このTIBCO Spotfireのデスクトップ版を導入する方法から、続いてマイクロアレイデータ解析の一事例(公共データベースから取得したマイクロアレイデータに自分の実験のデータを追加した上で、それらのデータを正規化(Normalize)し、階層的クラスタリング(Hierarchical clustering)を行う)を示しながら基本的な操作方法を紹介します。
今回は発現データの例として、遺伝子発現解析の基準となるデータを閲覧できるRefExで提供されているGSE7307の処理済みデータと、同じくRefExから提供されているGSE7307の組織特異的発現データを用い、公共データと自分の実験データに見立てています。