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ゲノムデータベース、ゲノムアノテーション @ AJACS越後
本日の統合TVは、2018年6月26-27日に開催された統合データベース講習会:AJACS越後から、新潟大学工学部 阿部 貴志 准教授 による「ゲノムデータベース、ゲノムアノテーション」をお送りします。約1時間29分です。
本講習では、ゲノムデータベースについてMicrobeDB.jpおよびPGDBjを例に紹介しながらゲノムアノテーションの概要を示すとともに、アノテーションパイプラインの構築についてDDBJ Fast Annotation and Submission Tool (DFAST)などの例を示しながら紹介しています。また、演習として任意のゲノム配列に対するアノテーションを行っています。
この動画と講習資料が同時に見られる「講習会 実習資料(AJACS)」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、ゲノムデータベースについてMicrobeDB.jpおよびPGDBjを例に紹介しながらゲノムアノテーションの概要を示すとともに、アノテーションパイプラインの構築についてDDBJ Fast Annotation and Submission Tool (DFAST)などの例を示しながら紹介しています。また、演習として任意のゲノム配列に対するアノテーションを行っています。
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見どころダイジェスト
- 04:42 1. ゲノムデータベース
- 08:13 1-1. 微生物統合DB MicrobeDB.jp
- 11:58 1-2. 植物統合DB PGDBj
- 2. ゲノムアノテーションの概要～アノテーション手法の紹介～
- 45:05 3. アノテーションパイプライン構築について～実例を元に、構築の考え方について～
- 01:18:14 4. 演習～任意のゲノム配列に対し、実際にアノテーションしてみよう～
- 01:12:30 5. その他のサービス例
- 01:17:00 6. 今後に向けて
動画ファイルのダウンロード
180814_AJACS69_02_abe.mov