ENA (European Nucleotide Archive)は、EMBL-EBI (欧州バイオインフォマティクス研究所) が運営する核酸配列の一次データとそれに付随するデータを包括的に収集しているレポジトリサイトです。ENAはNCBI、DDBJとともにINSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration)(日本語による説明(DDBJウェブサイト))を構成し、国際塩基配列データベース(INSD; International Nucleotide Sequence Database)を構築しています。ENAでは、塩基配列に関わるサンプル情報、実験情報、機器情報に加えて、データとしては配列トレース、配列、クオリティ値を含み、アセンブル、マッピング、機能アノテーションも提供しています。
今回は、その基本的な使い方について紹介します。
ENAを含めた次世代シークエンスデータベースの紹介と使い方のハンズオン講習会の動画も合わせてご参照ください。