TogoGenome はセマンティック・ウェブ技術を用いて、生物種・遺伝子・表現型・環境などの多様な情報を統合したゲノムデータベースです。すべての情報は Resource Description Framework (RDF) で統合されており、結果ページはリアルタイムに SPARQL 検索を実行した結果から表示されます。TogoGenome では遺伝子機能・生物系統・表現型・環境のオントロジーによるファセット検索が可能です。また、比較ゲノム機能では遺伝子の機能アスペクトと複数の生物種の組み合わせから、生物種間に共通する遺伝子や特定の生物種にユニークな遺伝子を検索できます。
TogoGenome は iframe や Web components としてひとまとまりの情報を可視化する TogoStanza の組み合わせで作られており、他のデータベースにおいても再利用可能なモジュールを多数提供しています。
今回は、TogoGenome を使ったゲノムアノテーションの検索から、比較ゲノム検索、配列検索、キーワード検索などの基本的な使い方について紹介します。