Expression Atlas は、EMBL-EBI (欧州バイオインフォマティクス研究所) が運営する、様々な生物種における遺伝子発現情報を提供するウェブサイトです。40 の生物種について、3000 以上の実験に基づき、組織や細胞種、発生段階、疾患の有無などの条件別に、遺伝子の発現情報をまとめています。データは GTEx、Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE)、ENCODE、FANTOM5 などのプロジェクトに由来します。全てのデータは手動で専門家によりキュレーションされています。
今回は、遺伝子名で検索し発現している実験条件を検索する方法をはじめ、遺伝子の発現に差が見られる実験条件の検索、生物学的条件から発現している遺伝子を検索する方法、さらに、一細胞 RNA-seq の実験データを検索できるSingle Cell Expression Atlasの使い方を紹介します。