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CLC Genomics Workbench の使い方 変異解析編

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CLC Genomics Workbench の使い方 変異解析編

CLC Genomics Workbenchは、 QIAGEN によって提供されている統合配列解析ソフトウェアです。生命科学データの解析に使われるいろいろなツールを統合されたインターフェースで扱うことができます。今回は、ヒトのゲノムリシーケンスのデータで第20染色体にマップされたリードをデモデータとして、CLC Genomics Workbench (Ver.11) を使った変異解析の方法について紹介します。

見どころダイジェスト

  • 00:28 1. シークエンスデータインポート
  • 01:26 2. 参照配列インポート
  • 02:58 3. クオリティチェックとトリミング
  • 06:29 4. マッピング
  • 08:05 5. ローカルリアラインメント
  • 09:07 6. 変異検出
  • 12:37 7. アミノ酸置換の解析
  • 15:36 8. 変異のフィルタリング
  • 17:52 9. 遺伝子のアノテーション
  • 19:25 10. 3D 構造解析

動画ファイルのダウンロード

180504_clc_snv.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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