Ensemblを使って、過去のバージョンのゲノムアノテーションを調べる

Ensembl Genome Browserは、 European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)(欧州バイオインフォマティクス研究所) で開発、維持されているゲノムブラウザ、ゲノムアノテーション閲覧システムのことです。今回は、Ensemblで使われていた過去のバージョンのゲノムとそのアノテーション(Ensembl Archives)を閲覧する方法について紹介しています。Ensembl のバージョンとゲノム配列のバージョンの違いは混同しやすいですが、ゲノム配列を使ったデータベースやアノテーションはどのバージョンのゲノム配列に対応しているかが非常に重要です。

見どころダイジェスト

  • 00:50 1. Ensembl Archiveの場所
  • 01:48 2. どのようなゲノム配列がアーカイブされているか調べる
  • 03:08 3. ある遺伝子に対応する過去のゲノムバージョンのエントリを調べる

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