【NGSハンズオン2015】NGS解析 - RNA-seq、カウントデータ取得以降の統計解析

見どころダイジェスト

  • 01:34 1. クラスタリング
  • 02:30 2. クラスタリング〜入力ファイル& R を起動〜
  • 04:31 3. クラスタリング〜作業ディレクトリの変更&作業ディレクトリと入力ファイルの確認〜
  • 06:32 4. クラスタリング〜コピペで実行、実行結果、出力ファイル〜
  • 09:35 5. クラスタリング〜clusterSample 関数〜
  • 35:07 6. クラスタリング〜結果の解釈〜
  • 39:20 7. 発現変動解析(2 群間比較)〜HS vs. RM〜
  • 43:32 8. 発現変動解析(2 群間比較)〜サブセット抽出〜
  • 46:28 9. 発現変動解析(2 群間比較)〜FDR〜
  • 50:58 10. 発現変動解析(2 群間比較)〜DEG 数の見積もり〜
  • 58:17 11. 発現変動解析(2 群間比較)〜樹形図と一致〜
  • 01:00:30 12. 発現変動解析(2 群間比較)〜M-A plot〜
  • 01:06:25 13. 発現変動解析(2 群間比較)〜DEG 検出結果〜
  • 01:18:25 14. Tips: log の世界
  • 01:20:47 15. 分布やモデル
  • 01:25:21 16. おさらい&「HS vs. PT」
  • 01:27:24 17. 「HS vs. RM」と「HS vs. PT」の比較
  • 01:31:33 18. サンプル間類似度
  • 01:40:22 19. 2 群間比較(DEG がほとんどない同一群の場合)
  • 01:49:45 20. 倍率変化を用いた場合
  • 01:57:42 21. 発現変動解析:3 群間比較など

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151116NGS_kadota.mov

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