公共の遺伝子発現データの検索や解析を行う

Human Brain Transcriptomeを使ってヒトの脳の発達に関する時空間トランスクリプトームを見る

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Human Brain Transcriptomeを使ってヒトの脳の発達に関する時空間トランスクリプトームを見る

HBT(Human Brain Transcriptome)は、発達期から成人期まで様々な段階の脳のトランスクリプトームの解析データをまとめたデータベースです。小脳皮質、視床背側神経核、線条体、扁桃体、海馬、大脳新皮質の6つの組織と、大脳新皮質の中でさらに11に分けた領域の発現を見ることができます。Gene Searchでは遺伝子名あるいはデータベースの遺伝子IDからその遺伝子の発現情報を検索したり、ある特定の期間に発現量が有意に変化している遺伝子を検索したりすることができます。Developmental Trajectoriesでは、細胞分裂マーカーの発現を元にして解析した、神経発生や神経伝達についてのデータを見ることができます。Dataから補足のデータや解析に使用したサンプルのデータをダウンロードすることもできます。

見どころダイジェスト

  • 00:36 1. 遺伝子名・IDから発現情報の検索
  • 03:23 2. 発現に有意な差が見られる遺伝子の検索
  • 05:09 3. 脳神経の発生および機能面の時空間的変化を検索

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130909HumanBrainTranscriptome.mov

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