Jalviewは多重アラインメントのビューワー/エディターです。Javaで作られており、Web上で動作するプラットフォームもあります。今回は、PCにインストールしたJalviewを使用して、多重アラインメントの結果から系統樹を作成し、また多重アライメントされた配列を削除・追加します。Jalviewのインストールは、
JalviewのHPから行うことができます。今回使用するTERT.faには、
KEGGに収載されているヒト、マウス、ゴリラなどに存在するTERT(テロメラーゼ逆転写酵素)の配列セットが書かれています。また、追加する配列はUniProt ID:
A2THE9です。