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2013.04.30
9
分
9
秒
作者:
TogoTV
編集:
Hiromasa Ono
PANTHERを使ってマイクロアレイデータを機能解析する
PANTHER
はマイクロアレイ実験から得られたデータを解析するツールです。このツールを使うことで発現変動のあった遺伝子群の特徴を可視化し、直感的に分析することができます。PANTHERという名前はProtein ANalysis THrough Evolutionary Relationshipsの頭文字に由来しています。ムービーではサンプルデータとして、
NCBI GEO
に登録されている公共の遺伝子発現データ(
GSE1657:Adipocyte Differentiation
)を用いて、
ヒトの脂肪細胞の分化過程で発現増加した上位500個の遺伝子群のリスト
を使って説明しています。
関連動画
見どころダイジェスト
1. リストのアップロード(40秒)
2
分
44
秒
2. GO Biological Process分析結果
5
分
21
秒
3. Bar Chart Gene Count
7
分
27
秒
4. 転写因子遺伝子(Protein Class)のリストをダウンロード
この動画のタグ
遺伝子
発現解析
可視化
転写因子
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130430_PANTHER.mov
DOI
https://doi.org/10.7875/togotv.2013.027
再利用時のライセンス
クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0
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