PANTHERを使ってマイクロアレイデータを機能解析する

PANTHERはマイクロアレイ実験から得られたデータを解析するツールです。このツールを使うことで発現変動のあった遺伝子群の特徴を可視化し、直感的に分析することができます。PANTHERという名前はProtein ANalysis THrough Evolutionary Relationshipsの頭文字に由来しています。ムービーではサンプルデータとして、NCBI GEOに登録されている公共の遺伝子発現データ(GSE1657:Adipocyte Differentiation)を用いて、ヒトの脂肪細胞の分化過程で発現増加した上位500個の遺伝子群のリストを使って説明しています。

見どころダイジェスト

  • 1. リストのアップロード(40秒)
  • 244 2. GO Biological Process分析結果
  • 521 3. Bar Chart Gene Count
  • 727 4. 転写因子遺伝子(Protein Class)のリストをダウンロード

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130430_PANTHER.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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