Biomart v0.8を使ってIDから遺伝子情報を取得する

BioMartは、the Ontario Institute forCancer Research (OiCR) とthe European Bioinformatics Institute (EBI) が共同で開発しているクエリ指向型データ管理システムです。 先日、BioMartのバージョンアップが行われインターフェースの大幅な変更や新機能の追加がなされました。 この動画ではバージョンアップで変更された点を、IDから遺伝子のDescription等を取得する中で解説し、また、追加された新機能についても解説を行なっていきます。

見どころダイジェスト

  • 1.IDから遺伝子のDescriptionなどをとってくる (36秒)
  • 03:47 2.Gene retrievalやsequence retrievalについて
  • 04:23 3.ID converterについて
  • 05:09 4.Identifier searchについて

動画ファイルのダウンロード

120127biomart_v0.8.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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