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2011.10.24

09:45

作者:  TogoTV

編集:  小野 浩雅

mfoldを使って核酸の二次構造を予測する〜基本操作編〜

mfoldは核酸が塩基対を形成する際の自由エネルギー変化を計算して、二次構造を予測するツールです。mfoldでは、自由エネルギーが最小になる塩基対の形成の仕方を計算して二次構造を表示するだけでなく、エネルギー最小のものよりもエネルギーが高いものも計算して、その後の様々な解析に役立つデータが数多く出力されます。

関連動画

    見どころダイジェスト

    • 1.配列の入力〜パラメーターの設定 (55秒)
    • 04:31 2.Energy dot plotを見る
    • 06:08 3.計算した二次構造を図で見る
    • 06:53 4.構造の画像ファイルをまとめてダウンロードする
    • 07:34 5.Energy dot plotで構造を比較する
    • 08:05 6.Circular structure plotを使って塩基対の形成の仕方を見る

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      111024mfold_1.mov

      DOI

      https://doi.org/10.7875/togotv.2011.123

      再利用時のライセンス

      クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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