本日の統合TVは、2019年8月7日に開催された統合データベース講習会:AJACS番町3から、国立遺伝学研究所 森 宙史 助教による「【How to use1】MicrobeDB.jpの使い方」をお送りします。約25分です。
目標:公共の微生物のゲノム・メタゲノム解析データ等をMicrobeDB.jpで検索する方法、および、VITCOMIC2、LEA等を用いて、自分の持つマイクロバイオームのアンプリコンシーケンスデータやメタゲノムシーケンスデータから系統組成を推定し、系統組成が似たMicrobeDB.jp上のメタゲノム解析データを検索する方法がわかる。
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