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パスウェイデータベースおよびプロテオームデータベースの紹介 @ AJACS浜松
本日の統合TVは、2018年1月16-17日に開催された統合データベース講習会:AJACS浜松から、新潟大学大学院医歯学総合研究科奥田 修二郎 氏 による「パスウェイデータベースおよびプロテオームデータベースの紹介」をお送りします。約1時間55分です。
本講習では、パスウェイデータベースの概要とデータ形式などを紹介するとともに、主にBioCyc、Reactome、KEGGの使って、手持ちのオミックスデータをパスウェイにマッピングする方法について実習形式で紹介しています。
この動画と講習資料が同時に見られる「講習会 実習資料(AJACS)」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、パスウェイデータベースの概要とデータ形式などを紹介するとともに、主にBioCyc、Reactome、KEGGの使って、手持ちのオミックスデータをパスウェイにマッピングする方法について実習形式で紹介しています。
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見どころダイジェスト
- 03:50 1. パスウェイデータベースとは
- 10:24 2. パスウェイデータベースでの表現
- 12:48 3. パスウェイデータベースのデータ形式
- 17:27 4. BioCyc
- 25:54 5. Reactome
- 31:32 6. KEGG PATHWAY
- 01:29:18 7. プロテオームデータベース
- 01:32:38 8. ProteomicsDB
- 01:40:01 9. Human Protein Map
- 01:41:39 10. The Human Protein Atlas
- 01:44:03 11. リポジトリデータベース
- 01:45:10 12. PRIDE Archive
- 01:50:35 13. jPOST repository
動画ファイルのダウンロード
180117_AJACS68_02_okuda.mov