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【NGSハンズオン2016】第2部 NGS解析 (初～中級) - RNA-seq
本日の統合TVは、2016年7月19日(火) ～ 8月4日(木)に開催された、バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム 平成28年度 次世代シークエンサ(NGS)ハンズオン講習会 から、アメリエフ株式会社 山口 昌雄 氏・尾上 広祐 氏 による「第2部 NGS解析 (初～中級) RNA-seq」をお送りします。約5時間3分です。
本講習では、主にRNA-seqにおける代表的なパイプラインについてハンズオン形式で学びます。
(注: 冒頭から18分過ぎまで配布資料ではなく、amelieffのウェブページ/資料をもとに講義を行っておりますが、現在は閲覧できません。)
講義資料 (PDF: 約6.2MB)
コマンド集(GitHub)
関連ウェブサイトのリンク情報などを含む資料ページはこちらです。
この動画と講習資料が同時に見られる「AJACS講習会資料」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
本講習では、主にRNA-seqにおける代表的なパイプラインについてハンズオン形式で学びます。
(注: 冒頭から18分過ぎまで配布資料ではなく、amelieffのウェブページ/資料をもとに講義を行っておりますが、現在は閲覧できません。)
講義資料 (PDF: 約6.2MB)
コマンド集(GitHub)
関連ウェブサイトのリンク情報などを含む資料ページはこちらです。
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講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。
見どころダイジェスト
- 18:54 【講義パート】1. RNA-seqとは
- 21:42 【講義パート】2. RNA-seq解析の流れ
- 27:03 【講義パート】3. 公開データの取得
- 53:12 【講義パート】4. クオリティコントロール
- 01:03:11 【講義パート】5. マッピング
- 01:23:03 【講義パート】6. 発現定量
- 01:38:03 【実習パート】7. クオリティコントロール
- 02:20:52 【実習パート】8. マッピング
- 03:31:02 【実習パート】9. 発現定量
- 04:18:43 【実習パート】10. 発現比較
- 04:38:10 【実習パート】11. 可視化
- 04:51:35 【実習パート】12. まとめ
動画ファイルのダウンロード
161020NGS_06_amelieff.mov