【NGSハンズオン2016】第2部 NGS解析 (初~中級) - ゲノムReseq、変異解析

本日の統合TVは、2016年7月19日(火) ~ 8月4日(木)に開催された、バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム 平成28年度 次世代シークエンサ(NGS)ハンズオン講習会 から、アメリエフ株式会社 山口 昌雄 氏・三澤 拓真 氏 による「第2部 NGS解析 (初~中級) ゲノムReseq、変異解析」をお送りします。約4時間28分です。
本講習では、主にゲノムReseqおよび変異解析における代表的なパイプラインについてハンズオン形式で学びます。
講義資料 (PDF: 約3.3MB)
コマンド集(GitHub)
関連ウェブサイトのリンク情報などを含む資料ページはこちらです。
この動画と講習資料が同時に見られる「AJACS講習会資料」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。

見どころダイジェスト

  • 03:04 【講義パート】1. Reseqとは
  • 09:04 【講義パート】2. 検出可能な遺伝子変異
  • 16:07 【講義パート】3. 解析パイプラインとは
  • 18:34 【講義パート】4. 公開データの取得と利用
  • 41:46 【講義パート】5. クオリティコントロールとは
  • 45:07 【講義パート】6. マッピングとは
  • 49:59 【講義パート】7. 変異検出とは
  • 01:00:09 【講義パート】8. アノテーションとは
  • 01:02:39 【講義パート】9. 後半パート (実習)で行うこと
  • 01:20:07 【実習パート】10. 公開データの確認
  • 01:30:11 【実習パート】11. クオリティコントロール
  • 02:17:48 【実習パート】12. マッピング
  • 03:04:38 【実習パート】13. 変異検出
  • 03:46:19 【実習パート】14. アノテーション
  • 04:14:07 【実習パート】15. 解析結果の可視化
  • 04:21:15 【実習パート】16. まとめ
  • 04:25:58 【実習パート】17. 最後に

動画ファイルのダウンロード

161019NGS_05_amelieff.mov

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