【NGSハンズオン2016】第2部 NGS解析 (初~中級) - NGS解析基礎

本日の統合TVは、2016年7月19日(火) ~ 8月4日(木)に開催された、バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム 平成28年度 次世代シークエンサ(NGS)ハンズオン講習会 から、アメリエフ株式会社 山口 昌雄 氏・窪川 美雪 氏 による「第2部 NGS解析 (初~中級) NGS解析基礎」をお送りします。約2時間38分です。
本講習では、主に
・ファイル形式
・可視化 (IGV)
・quality check
・マッピング
・アセンブル
をハンズオン形式で学びます。
講義資料 (PDF: 約2.7MB)
コマンド集(GitHub)
関連ウェブサイトのリンク情報などを含む資料ページはこちらです。
この動画と講習資料が同時に見られる「AJACS講習会資料」ページはこちらです。
講習会の一連の動画はYouTubeの再生リストからもご覧いただけます。

見どころダイジェスト

  • 14:30 【講義パート】1. NGSデータ解析で主に使用するファイル形式
  • 01:13:48 【実習パート】2. データのクオリティチェックとクリーニング
  • 01:49:23 【実習パート】3. NGSデータのマッピング
  • 01:54:24 【実習パート】4. 【実践!】新しいソフトウェアの導入

動画ファイルのダウンロード

161018NGS_04_amelieff.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

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