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2016-09-27

_ [可視化][発現情報][NGS] Metascapeを使って、遺伝子リストの生物学的解釈をする

Metascapeを使って、遺伝子リストの生物学的解釈をする

マイクロアレイ実験や次世代シーケンシング(NGS)などで得られた大量な遺伝子を扱う際に、どういう機能を持つ遺伝子が変化する傾向にあるかを知るエンリッチメント解析は非常に有用な解析手法です。

Metascapeは、ウェブ上でヒト・マウス・ラットのエンリッチメント解析ができるツールです。リストに含まれる遺伝子にどのような機能を持つものが多いか、クラスタリングなどによって直感的に分析することができます。IDリストのほかタイムコースなどの複数リストデータも使用可能で、複数リスト間のアノテーションについて差分を表示することもできます。

本動画ではMetascapeの基本的な使い方について、説明します。

YouTube 版はこちら

  1. 1. Single listのエンリッチメント解析 (0:43)
  2. 2. ID conversion (1:26)
  3. 3. Annotation (1:51)
  4. 4. Membership (2:25)
  5. 5. Enrichment (3:12)
  6. 6. エンリッチメント解析の結果 (3:21)
  7. 7. Multiple listのエンリッチメント解析 (4:47)

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Keywords: エンリッチメント解析,Metascape


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