統合TV 統合TVは、ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が発信する生命科学分野の有用なデータベース(DB)やウェブツールの活用法を動画で紹介するウェブサイトです。くわしくは はじめての方へ をご覧ください。ご質問、ご要望は、お問い合わせ もしくは ライフサイエンスQA からお願いします。TogoTV beta ('togo' means 'integration' in Japanese) is an archive of tutorial videos expounding how to use biological databases and tools. Although most of contents are currently depicted in Japanese, you can find English contents in TogoTV international. Please post any comments, suggestions, and requests at each content page, e-mail to the address described at the bottom of each page or contact form. This site is provided by Database Center for Life Science (DBCLS) and funded by MEXT Integrated Database Project in Japan.

新しい統合TVはこちらから!→ 統合TV

TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

番組カテゴリ:BIRD | DBCLS | EMBOSS | English | Firefox | IE6 | IE7 | IE8 | JST | NGS | PC環境設定 | commons | macosx | presentaiton | presentation | safari | winxp | アミノ酸 | ゲノム | ソフトウェア | タンパク質 | パスウェイ解析 | ポータル | 二次構造 | 化合物 | 可視化 | 塩基配列 | 多型情報 | 家系図 | 文献検索 | 構造解析 | 疾患情報 | 発現情報 | 設計ツール | 辞書 | 遺伝子 | 配列解析 Search categories: DBCLS | EMBOSS | English | Firefox | IE6 | IE7 | IE8 | commons | macosx | presentation | safari | winxp | amino acid | genome | protein | pathway analysis | portal | gene | nucleotide sequence | chemical compound | visualization | dictionary | disease information | design tool | polymorphism information | secondary structure | sequence analysis | expression profile | literature search


2015-10-06

_ [可視化][パスウェイ解析][発現情報] Reactome を使ってパスウェイ情報を検索する ~解析データのマッピング~

Reactome を使ってパスウェイ情報を検索する ~解析データのマッピング~

Reactome はヒトの生体中での反応やパスウェイを整備したデータベースです.それぞれの分野の専門家が編集しているため,信頼性の高いデータが得られます.代謝以外にもシグナル伝達や膜輸送,感染など様々なパスウェイが扱われています.DNA マイクロアレイやプロテオーム解析,メタボローム解析の結果を解釈する際にも利用できます.本動画はサンプルデータを用いて,ある分子がより深く関与するパスウェイを探したり,発現量をパスウェイにマッピングしたりする方法を説明します.

※動画には BGM が付与されていますので,閲覧の際にはご注意ください.

YouTube 版はこちらです.

  1. 0:52 入力した分子がより深く関与するパスウェイを探す
  2. 3:20 発現量をパスウェイにマッピングする
  3. 7:23 パスウェイ図を画像形式でダウンロードする

Get the Flash Player to see this movie.この動画を再生するにはAdobe Flash Player (無料)が必要です

また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: Reactome, Pathway, パスウェイ解析, 可視化, 発現情報
References: 21067998


トップ «前の日記(2015-10-05) 最新 次の日記(2015-10-07)» 編集
Creative Commons License「統合TV」は、クリエイティブコモンズ・ライセンス(CC)表示 2.1 日本 のもとでライセンスされています。Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution 2.1 Japan License
統合TVのQRコード
文部科学省委託研究開発事業「統合データベースプロジェクト」MEXT Integrated Database Project
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター 統合TVチームDatabase Center for Life Science (DBCLS), Research Organization of Information and Systems (ROIS)
サイトポリシーSite Policies