InterProはタンパク質のファミリー・ドメイン・モチーフに関するさまざまなデータベースを統合した
EBI (European Bioinformatics Institute)のサービスです。この動画では、InterProの使い方を、DB検索ツールであるInterProScanを用いて説明しています。ある一つのアミノ酸配列をInterProが統合している複数のデータベースにまとめて検索にかけ、問い合わせた配列にヒットしたタンパク質ファミリーやドメイン・リピート構造を効率的に推測することができます。
この動画では機能既知のタンパク質(ヒトの脂肪代謝関連遺伝子の一つである
PPARG)の配列を用いていますが、機能未知のタンパク質のアミノ酸配列を検索にかけることで、配列解析による機能アノテーションを簡単に行うことができます。