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2015-02-04

_ [タンパク質][遺伝子][発現情報] The Human Protein Atlasでヒトのタンパク質の発現情報を画像データとともに調べる

The Human Protein Atlasでヒトのタンパク質の発現情報を画像データとともに調べる

The Human Protein Atlasは、スウェーデンの研究グループ(スウェーデン王立工科大学、ウプサラ大学、SciLifeLab)が提供している、ヒトのタンパク質の発現情報データベースです。

さまざまなヒトの組織やガン細胞、細胞株におけるタンパク質発現情報・RNA発現情報およびタンパク質局在を、特異的抗体を用いて得られた免疫組織化学染色写真や免疫蛍光染色写真とともに調べることができます。また、測定に使用されている抗体をメーカーへのリンクから購入することもできます。

2014年11月にアップデートされた最新バージョン (version: 13) では、213種類の組織および細胞株のサンプルを対象にして、16,975個の遺伝子 (これはヒトの遺伝子数のおよそ7割に相当する) に由来する24,028種類の抗体を用いて測定されたデータが閲覧できます。

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

YouTube版はこちらです。

  1. 1. タンパク質の通称や遺伝子名での検索 (0分34秒)
  2. 2. 目的のタンパク質の基本情報の閲覧 (1分44秒)
  3. 3. 目的のタンパク質を抗原とする抗体の基本情報の閲覧 (2分42秒)
  4. 4. TISSUE ATLASの見方 (3分35秒)
  5. 5. SUBCELL ATLASの見方 (4分46秒)
  6. 6. CELL LINE ATLASの見方 (5分49秒)
  7. 7. CANCER ATLASの見方 (6分20秒)
  8. 8. 測定に使用されている抗体の購入サイトヘの移動 (7分25秒)

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