統合TV 統合TVは、ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)が発信する生命科学分野の有用なデータベース(DB)やウェブツールの活用法を動画で紹介するウェブサイトです。くわしくは はじめての方へ をご覧ください。ご質問、ご要望は、お問い合わせ もしくは ライフサイエンスQA からお願いします。TogoTV beta ('togo' means 'integration' in Japanese) is an archive of tutorial videos expounding how to use biological databases and tools. Although most of contents are currently depicted in Japanese, you can find English contents in TogoTV international. Please post any comments, suggestions, and requests at each content page, e-mail to the address described at the bottom of each page or contact form. This site is provided by Database Center for Life Science (DBCLS) and funded by MEXT Integrated Database Project in Japan.

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TogoTV international

TogoTV paper published in Briefings in Bioinformatics. (2011/7/29)

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2014-12-10

_ [DBCLS][NGS][可視化][塩基配列] DBCLS SRAを使ってNGSデータを検索する

DBCLS SRAを使ってNGSデータを検索する</p>
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DBCLS SRAは、公共データベース(SRA [NCBI], ENA [EBI], DRA [DDBJ])に登録されたNGS(次世代シーケンサ)データについて、さまざまな統計情報から閲覧、比較、データのダウンロードができる目次サイトです。生物種、研究目的、測定機器、論文の有無などの条件からNGSデータを含む研究プロジェクトを検索し、それに関連するシーケンスデータをダウンロードすることができます。

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

YouTube版はこちらです。

  1. 1. 各種統計の紹介 (0分21秒)
  2. 2. 条件を指定した研究プロジェクトの検索 (0分32秒)
  3. 3. プロジェクトページの見方 (2分17秒)
  4. 4. リードデータのクオリティ情報の閲覧とダウンロード (3分28秒)

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