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2014-03-02

_ [化合物][構造解析] ChEMBLを使って医薬品候補となる化合物について調べる

ChEMBLを使って医薬品候補となる化合物について調べる

ChEMBLdbは、創薬研究に有用な医薬品化合物の情報を提供するデータベースです。現在、約50万個の化合物情報、約190万件の活性情報及びそれらのターゲット情報が登録されています。ユーザーは、生物活性化合物の情報を部分構造検索や類似性検索で調査したり、また、ターゲットのアミノ酸配列からBLAST検索でアッセイ情報を収集することができます。

今回は、タンパク質を名前/系統樹/BLAST配列から指定しリガンドを探すTarget Search機能と、化合物の構造を投げ、類似性から探す/名前から探す/SMILE・IDから探すCompound Searchを中心に説明します。

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

YouTube版はこちらです。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. 標的のタンパク質などの名前を入力し、"Target" で検索する (0分38秒)
  2. 2. Compound Report Card (1分52秒)
  3. 3. FASTA 配列から目的タンパク質を指定しリガンドとなる化合物を探す (2分38秒)
  4. 4. 目的化合物の名称から検索 (3分27秒)
  5. 5. 医薬品情報を確認する (3分52秒)

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