2013-12-18 GeneStudioを使って塩基配列をアセンブルする

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GeneStudioは、主にサンガーシークエンスによって得られた波形データを、塩基配列情報に変換したり、アセンブルしたりすることができるフリーウェアです。今回は複数の波形データ(ABI)をもとに、それらをアセンブルする方法を紹介します。類似のフリーウェアであるBioEditでも簡単なアセンブルをすることはできますが、GeneStudioではforward/reverse鎖を自動で調節してcontigを生成することができ、また波形データを見ながら手動で各readをトリムすることが可能です。

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2013.099

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