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2013-06-27

_ [presentation][English] Semantic Web Technologies in Proteomics. An EBI overview

Semantic Web Technologies in Proteomics. An EBI overview

NBDC / DBCLS BioHackathon 2013 was held in Tokyo, Japan. Main focus of this BioHackathon is semantic interoperability and standardization of bioinformatics data and Web services.

The participants discussed, explored and developed web applications and interoperability (DDBJ/UniProt, SADI, TogoGenome, Schema.org etc.), generation and standardization of RDF data (Open Bio* tools, SIO, FALDO, Identifiers.org etc.), text-mining, NLP and ontology mapping (LODQA, BioPortal, NanoPublication etc.), quality assessment of SPARQL endpoints (availability, contents, CORS etc.) and standardization of RDF data in specific domains.

On the first day of the BioHackathon (Jun. 23), public symposium of the BioHackathon 2013 was held at Tokyo Skytree Space 634.

In this talk, Antonio Fabregat makes a presentation entitled "Semantic Web Technologies in Proteomics. An EBI overview". (14:36) (Slides)

YouTube version is here.

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Keywords: biohackathon,DDBJ,Uniplot,SADI,togogenome,Schema.org,open bio,SIO,FALDO,Identifiers.org,text-mining,NLP,ontology,LODQA,Bioportal,NanoPublication,SPARQL,RDF


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