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TogoTV international

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2013-05-30

_ [PC環境設定] Open Refine(旧Google Refine)の使い方 〜応用編・TogoWS RESTを活用する〜

Open Refine(旧Google Refine)の使い方 〜応用編・TogoWS RESTを活用する〜

Open Refineは、さまざまなデータをきれいに整形したり、欲しい形のものに変換したり、簡単な解析を行ったりすることができるソフトで、表計算ソフトExcelにはないさまざまな機能を持っています。

前回「Open Refine(旧Google Refine)の使い方 〜導入・基本編〜」の動画では、Open Refineのダウンロード、およびCSVファイルを用いた文字データと数字データの整形について紹介しました。

今回は、Open Refineと、TogoWS RESTというDBCLSの提供するサービスを用いて、大量の遺伝子やタンパク質のIDのリストから、それぞれのIDに関連するアノテーションを一括取得する方法を紹介します。

(TogoWS RESTの使い方を紹介する統合TVはこちら

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

YouTube版はこちらです。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. TogoWS RESTの紹介(18秒)
  2. 2. GenBank nucleotide IDのリストから各遺伝子のアノテーションを一括取得する (59秒)
  3. 3. 同じIDのリストから各遺伝子の個々のアノテーションを取得する(3分9秒)

Get the Flash Player to see this movie.この動画を再生するにはAdobe Flash Player (無料)が必要です

また、JavaScriptをOnにする必要があります。
Keywords: OpenRefine,GoogleRefine,TogoWS,データ整形,一括取得


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