タンパク質配列・構造解析ツールStrapを使い倒す 〜基本編〜

Strapは、複数のタンパク質を立体構造や配列を比較しながら整理できる、フリーのJavaアプリケーションです。タンパク質の系統樹の作成や二次構造の予測、また整理した配列を図に変換することもできます。OSはWindows, Macintosh, Linux, Unixに対応しています。今回はStrapの基礎的な使い方として、アプリケーションのインストール、アミノ酸配列の色分け、タンパク質の3D画像の表示、アミノ酸配列の編集、図への変換、データのインポートとエクスポートの方法などを紹介しています。

見どころダイジェスト

  • 00:28 1.Strapのインストール
  • 01:31 2.インターフェースの説明
  • 02:05 3.アミノ酸配列の色分け
  • 03:51 4.タンパク質の3D画像(.PDB)の表示
  • 05:51 5.タンパク質の立体構造(類似構造)ファイルの検索
  • 08:18 6.アミノ酸配列のalign、ギャップ挿入
  • 09:13 7.読み込まれているデータファイルのコピー
  • 09:46 8.アミノ酸配列を元にしたWordファイル、図の作成
  • 10:17 9.ワードパッド、Webブラウザからドラッグ&ドロップによるデータのインポート

動画ファイルのダウンロード

130227Strap.mov

再利用時のライセンス

クリエイティブ・コモンズ CC-BY-4.0

スキル別コースから探す

    新着動画

      視聴ランキング

        新着イラスト