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2012-12-27

_ [遺伝子][パスウェイ解析][可視化] Sigma-AldrichのYour Favorite Geneを使って遺伝子に関連するパスウェイや機能などの様々な情報を調べる 2012

Sigma-AldrichのYour Favorite Geneを使って遺伝子に関連するパスウェイや機能などの様々な情報を調べる 2012

Sigma-AldrichYour Favorite Geneは、遺伝子や疾患、組織、パスウェイなどを検索対象として、そのパスウェイや相互作用ネットワーク、関連文献など様々な情報を調べることができるツールです。今回は「PPAR-γ」と呼ばれる脂肪細胞分化や筋肉でのグルコース取り込みに関係する核内レセプターを例として用いて、Your Favorite Geneの機能について網羅的に解説しています。

また、今回紹介している機能に加えて、Ingenuity Pathways Analysis(IPA)のライセンスを購入することによって、より多くの機能を使用することが出来ます。

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. 自分が調べたい遺伝子の入力 (0分46秒)
  2. 2. 相互作用する遺伝子や化合物の表示 (1分51秒)
  3. 3. 関連するパスウェイの可視化 (3分34秒)
  4. 4. 関連する論文データなどの検索 (4分40秒)
  5. 5. 発現量が有意に変化したマイクロアレイのデータセットの検索 (6分30秒)
  6. 6. 保存配列、CpGアイランド、メチル化位置の検索 (7分16秒)
  7. 7. SNPの検索 (8分17秒)

YouTube版はこちらです。

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また、JavaScriptをOnにする必要があります。
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