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2012-11-05

_ [タンパク質][構造解析] MMDBを使ってタンパク質の構造を知る

MMDBを使ってタンパク質の構造を知る

MMDBNCBIが提供するデータベースの一つです。MMDBではタンパク質やRNAの立体構造を知ることができます。また、それが複合体を形成していればそれぞれの物質の位置関係などを知ることもできます。MMDBはNCBIの他のデータベースであるPubChem, PubMed, CDDなどと相互連携しています。

今回は、MMDBの使い方として、構造が知りたいタンパク質に関連するページの探し方と、その見方を紹介しています。

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1.NCBI、またはMMDBのページの"Structure"から構造を直接検索 (0分37秒)
  2. 2.MMDBのページの見方 (1分19秒)
  3. 3.アラインメントを利用した類似構造の検索 (4分27秒)
  4. 4.GI numberから直接検索 (8分32秒)

YouTube版はこちらです。

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