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BioMartを使い倒す〜遺伝子の上流配列を取得する〜2012
biomartは、the Ontario Institute for Cancer Research (OiCR) と the European Bioinformatics Institute (EBI) が共同で開発しているクエリ指向型データ管理システムです。今回は、Ensemblのbiomartを用いて、全ての遺伝子の転写開始点から上流の配列1kbをマウスゲノムから抽出してFASTA形式で得る方法について説明しています。
見どころダイジェスト
- 1.BioMartトップページ (27秒)
- 01:10 2.DATASETSの選択
- 01:39 3.SEQUENCES
- 02:19 4.FILTERS
- 02:48 5.HEADER INFORMAION
- 03:12 6.検索結果の表示
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120720biomart_upstream.mov