2012-06-26 Avadis NGS の使い方〜ChIP-seq編〜

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今回の統合TVでは Avadis NGS による ChIP-seq 解析の方法を解説します。Avadis NGS は次世代シーケンサ(Next Generation Sequencer 以下 NGS)から得られたデータの解析のための商用ソフトウェアです(無料で20日間試用できます)。Strand Scientific Intelligence 社が開発、日本では Agilent 社が販売しています。Avadis NGS ではマッピングされたショートリードのデータ(SAM や BAM フォーマット)を読み込み、クオリティ・チェックを施した上で各種の解析およびその可視化を行う、という一連の流れを一つのソフトだけで行うことができます。

この動画を引用する際はDOIをご利用ください。 DOI: 10.7875/togotv.2012.061

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