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2012-06-12

_ [ゲノム][遺伝子][タンパク質] オーソログDB Inparanoidの使い方

オーソログDB Inparanoidの使い方

Inparanoidは、スウェーデンのストックホルムバイオインフォマティクスセンター(SBC)が提供するオーソログのデータベースで、17種類の生物についてそれぞれのオーソログ遺伝子/タンパク質を調べることができます。

今回の動画では、Inparanoidで使うことのできる4つのオーソログ検索方法について紹介します。

今回紹介したInparanoid以外にもオーソログのデータベースは複数存在しますが、それらについての比較論文が出ています。(情報提供元

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※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. Inparanoidへの行き方(17秒)
  2. 2. Browse機能の使い方(45秒)
  3. 3. オーソログの詳細ページの解説(2分12秒)
  4. 4. Gene search機能の使い方(4分23秒)
  5. 5. Text search機能の使い方(6分11秒)
  6. 6. Blast機能の使い方(7分35秒)

YouTube版はこちらです。


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