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2012-05-25

_ [EMBOSS][塩基配列][配列解析][アミノ酸] DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜配列変換編〜

DBCLS Galaxy EMBOSSの使い方〜配列変換編〜

Galaxyは主に生物系のデータ(ゲノムなど)を解析するための環境です。ウェブ上のインターフェースで簡単に操作できます。この動画では、DBCLSがGalaxyに独自の機能を組み込んだDBCLS Galaxy内で解析ツールパッケージの1つであるEMBOSSを使う方法を説明します。今回は、主に配列を変換するツール(revseq, prettyseq, sixpack, backtranseq)の紹介をします。

サンプル配列としてヒトの脂肪代謝遺伝子(peroxisome proliferator-activated receptor(PPAR) gamma)を使用しています。

※動画にはBGM音声が付与されていますので、閲覧の際にはご注意ください。

【ダイジェスト】下記のリンクをクリックするとその場面から再生されます。

  1. 1. 配列データのアップロード (0分51秒)
  2. 2. revseqの使い方 (2分42秒)
  3. 3. prettyseqの使い方 (4分1秒)
  4. 4. sixpackの使い方 (6分36秒)
  5. 5. backtranseqの使い方 (7分26秒)

YouTube版はこちらです。

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